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        <title>Wiki du CENIR</title>
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        <title>Wiki du CENIR</title>
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        <title>accueil</title>
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        <description>Le wiki du CENIR est un site collaboratif sur lequel sont exposées les informations scientifiques, techniques et administratives concernant les projets réalisés dans le centre. Pour des raisons de confidentialité, vous ne trouverez pas de description des protocoles effectués au CENIR ni de leurs éventuels résultats, seulement des données sur ce qu'il est possible de faire, comment, où, avec qui, etc.
Seuls des rédacteurs autorisés sont en mesure de modifier ou de créer de nouvelles pages sur ce …</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/anova?rev=1324028377&amp;do=diff">
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        <title>anova</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/anova?rev=1324028377&amp;do=diff</link>
        <description>mega_anova is used to compare the differences between groups of means. The design to be analyzed (or data model) can comprise any number of independent factors, each with multiple levels, and with or without repeated measurements. 


The output files (F and p or -logp values for every main effect and interaction) are in lena format.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/biopac?rev=1247849934&amp;do=diff">
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        <title>biopac</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/biopac?rev=1247849934&amp;do=diff</link>
        <description>Le CENIR possède un système Biopac permettant de :


	*  relever la réponse électrodermale (ampli GSR100C + LEAD108 + EL509 + GEL)
	*  relever l'électromyogramme (ampli EMG100C + LEAD108 + EL508)
	*  enregistrer l'électrocardiogramme (ampli ECG100C + LEAD108 + EL508)
	*  enregistrer la courbe de respiration du sujet (ampli RSP100C + TSD110-MRI + RSD201)</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/boitier_synchro?rev=1246020671&amp;do=diff">
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        <dc:date>2009-06-26T14:51:11+02:00</dc:date>
        <title>boitier_synchro</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/boitier_synchro?rev=1246020671&amp;do=diff</link>
        <description>Développement d'un boîtier de synchronisation pour remplacer le boîtier Siemens (fORP Current Design).

Ce boîtier sera composé d'un afficheur LCD piloté par 4 boutons de direction et un bouton de sélection. L'interface étant assurée par un microcontrôleur ATMega16, de fréquence interne 1 MHz.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/boutons_reponse?rev=1228830877&amp;do=diff">
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        <dc:date>2008-12-09T14:54:37+02:00</dc:date>
        <title>boutons_reponse</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/boutons_reponse?rev=1228830877&amp;do=diff</link>
        <description>Le CENIR possède différents types de boutons réponse IRM compatible. Ceux-ci permettent de recevoir et d'enregistrer les réponses du sujet lors d'une tâche fonctionnelle et de déterminer les temps de réponse.

Current Design


Nous avons retenu la société Current Designs et choisi un ensemble de boîtiers réponse de la série fORP.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/capteurs_meg?rev=1332837717&amp;do=diff">
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        <dc:date>2012-03-27T10:41:57+02:00</dc:date>
        <title>capteurs_meg</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/capteurs_meg?rev=1332837717&amp;do=diff</link>
        <description>La machine ELEKTA TRIUX est équipée de 102 points de mesure disposés autour de la tête en un arrangement approximativement sphérique, avec en chaque point un magnétomètre et deux gradiomètres planaires.

    Le magnétomètre mesure la composante radiale (alignée sur un rayon venant du centre de la sphère des capteurs) du champ magnétique sortant de la tête ou y rentrant.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/cenir?rev=1227005044&amp;do=diff">
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        <title>cenir</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/cenir?rev=1227005044&amp;do=diff</link>
        <description>Le CENIR a pour objet de fournir un plateau technique d’imagerie et d’explorations humaines de qualité, dédié à la recherche en neurosciences intégratives, cognitives et cliniques chez l’homme sain ainsi que chez le patient. Le centre assurera le développement de recherches théoriques et appliquées de haut niveau en neurologie et psychiatrie grâce au recrutement important de patients et au grand potentiel de recherche en neurosciences du Groupe Hospitalier de la Pitié-Salpêtrière.…</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/cenir_fat?rev=1317831495&amp;do=diff">
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        <dc:date>2011-10-05T18:18:15+02:00</dc:date>
        <title>cenir_fat</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/cenir_fat?rev=1317831495&amp;do=diff</link>
        <description>CENIR_FAT</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/choix_des_conditions_experimentales?rev=1333437666&amp;do=diff">
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        <title>choix_des_conditions_experimentales</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/choix_des_conditions_experimentales?rev=1333437666&amp;do=diff</link>
        <description>*   Démarche soustractive
	*  Plans factoriels
	*  Dessin paramétrique</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/cogent?rev=1255956737&amp;do=diff">
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        <dc:date>2009-10-19T14:52:17+02:00</dc:date>
        <title>cogent</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/cogent?rev=1255956737&amp;do=diff</link>
        <description>La majorité des protocoles en IRMf au CENIR sont programmés avec la librairie Cogent, développée au FIL (Londres).

Il s'agit d'une librairie Matlab, fonctionnant sous Windows, qui rend très accessible la gestion d'une fenêtre graphique, de l'envoi de stimuli audio et de la récupération de signaux via divers entrées d'un PC (clavier, souris, port parallèle, port série, etc), le tout synchronisé dans une base de temps précise à la milliseconde.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/datablocks?rev=1323943659&amp;do=diff">
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        <dc:date>2011-12-15T11:07:39+02:00</dc:date>
        <title>datablocks</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/datablocks?rev=1323943659&amp;do=diff</link>
        <description>This argument is optional. It is an array of strings  containing the list of the selected trials for the computation of anova.

By default, all the trials are taken into account.


Example:  

 mega_anova_with_sub (......,'datablocks', {'trial0', 'trial1'}, ....)</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/datahandler?rev=1286530473&amp;do=diff">
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        <title>datahandler</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/datahandler?rev=1286530473&amp;do=diff</link>
        <description>Logiciel développé par Antoine DUCORPS

dataHandler est le couteau suisse du Centre MEG/EEG.
Il permet d'intervenir de façons multiples et variées sur les signaux MEG et EEG (format CTF et LENA).
Par exemple pour réaliser une correction d'artéfacts, un filtrage, un ajout de marqueurs, un moyennage entre autre.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/define_your_design_structure?rev=1324028200&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-16T10:36:40+02:00</dc:date>
        <title>define_your_design_structure</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/define_your_design_structure?rev=1324028200&amp;do=diff</link>
        <description>You need to decide about:

	*  How many factors your design is made of: Let's take 3 factors for instance (A1, A2, A3)
	*  How many levels each factor Ai has : Let's suppose that our factorLevel is  [2,3,2] 
	*  Wich (.lena/.ds/.fiff) files are associated to each level  of each factor
	*  The name of your FileStruct variable: Let's say 'LenaFiles'</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/donnees?rev=1289838326&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2010-11-15T17:25:26+02:00</dc:date>
        <title>donnees</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/donnees?rev=1289838326&amp;do=diff</link>
        <description>*  IRM

	*  MEG-EEG</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/donnees_meg-eeg?rev=1289838758&amp;do=diff">
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        <dc:date>2010-11-15T17:32:38+02:00</dc:date>
        <title>donnees_meg-eeg</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/donnees_meg-eeg?rev=1289838758&amp;do=diff</link>
        <description>Les données MEG et EEG sont gérées et traitées exactement de la même manière

Gestion des données

	*  Tutoriel Linux

	*  Les formats

Traitement des données

	*  Philosophie générale

	*  Outils centre MEG-EEG

	*  Toolboxes installées</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/eeg_sous_irm?rev=1255953606&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2009-10-19T14:00:06+02:00</dc:date>
        <title>eeg_sous_irm</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/eeg_sous_irm?rev=1255953606&amp;do=diff</link>
        <description>Le CENIR a la compétence et le matériel nécessaire afin de réaliser des études mêlant les modalités EEG et IRMf. Les signaux de ces deux modalités sont acquis simultanément.

Le système EEG utilisé au CENIR est un système BrainAmp, avec un casque 64 voies et deux amplificateurs 32 voies. Les signaux sortent de la cage de Faraday par un guide d'ondes via des fibres optiques.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/elaboration_d_un_protocole?rev=1333438257&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2012-04-03T09:30:57+02:00</dc:date>
        <title>elaboration_d_un_protocole</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/elaboration_d_un_protocole?rev=1333438257&amp;do=diff</link>
        <description>*  Principes généraux
	*  Choix des conditions expérimentales
		*  Démarche soustractive
		*  Plans factoriels
		*  Dessin paramétrique

	*  Choix des mesures
		*  Ligne de base
		*  Pourquoi choisur ?
		*  Exemple de protocoles

	*  Choix des paramètres temporels de stimulation
		*  Principe de répétition
		*  Nombre de rythme de stimulations</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/epi_irmf?rev=1230130847&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2008-12-24T16:00:47+02:00</dc:date>
        <title>epi_irmf</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/epi_irmf?rev=1230130847&amp;do=diff</link>
        <description>Les séquences d'IRM fonctionnelle ont pour but d'acquérir le plus de volumes de cerveau (ou, parfois, de la zone d'intérêt) possible en un minimum de temps. Dans la pratique, la machine est capable de faire une image toutes les 2.4 à 3 secondes sans facteur d'accélération et peut descendre légèrement sous la barre des 2 secondes avec facteur d'accélération.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/equipements?rev=1289838968&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2010-11-15T17:36:08+02:00</dc:date>
        <title>equipements</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/equipements?rev=1289838968&amp;do=diff</link>
        <description>MEG

	*  La MEG du CENIR

	*  Stimulation et matériels périphériques

EEG

	*  Les systèmes EEG du CENIR

	*  Stimulation et matériels périphériques</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/eyetracker?rev=1234263887&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2009-02-10T12:04:47+02:00</dc:date>
        <title>eyetracker</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/eyetracker?rev=1234263887&amp;do=diff</link>
        <description>Afin de contrôler l'attention d'un sujet, de vérifier que son regard est fixe ou, au contraire, de suivre ses mouvements oculaires dans des conditions de poursuite de cible, il existe différents systèmes d'Eye-tracking compatibles IRM.

Le principe est toujours le même : une caméra infrarouge filme, en très gros plan, la pupille du sujet illuminée d'un faisceau de lumière infrarouge. L'utilisation d'infrarouges offre deux avantages distincts.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/factorlevel?rev=1323945611&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-15T11:40:11+02:00</dc:date>
        <title>factorlevel</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/factorlevel?rev=1323945611&amp;do=diff</link>
        <description>This argument is required. It is an array of m integers: [a1, a2 ..am]  where m is the number of factors and each ai is the number of levels of the ith factor.

	*  example:       ('FactorLevel',[3 2]) means that your design is made of two factors that have 3 and 2 levels respectively.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/fiche_de_contrindications?rev=1229012474&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2008-12-11T17:21:14+02:00</dc:date>
        <title>fiche_de_contrindications</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/fiche_de_contrindications?rev=1229012474&amp;do=diff</link>
        <description>Définition


La fiche de contrindications à l'IRM est un questionnaire de sécurité. Il permet de synthétiser les informations importantes concernant le sujet permettant ensuite à l'équipe du CENIR de juger si la personne est apte à réaliser un examen IRM.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/fileprefix?rev=1323943631&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-15T11:07:11+02:00</dc:date>
        <title>fileprefix</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/fileprefix?rev=1323943631&amp;do=diff</link>
        <description>This argument is optional. It is a string that specifies the prefix of the output file.

If not specified, the following default names are used:


  * FanovaEffect(i).lena         * panovaEffect(i).lena            * FanovaEffect(ij).lena             *  panovaEffect(ij).lena
	*  where i is the ith factor, and (ij) for the interaction between the ith and the jth factors.
	*</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/filestruct?rev=1323943557&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-15T11:05:57+02:00</dc:date>
        <title>filestruct</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/filestruct?rev=1323943557&amp;do=diff</link>
        <description>This argument is required. It is  the name of a a1-by-a2-by-...am cell array which you will need to create. 
(see below : this will be your main job !)

	*  m is the number of factors 
	*  ai is the number of levels of the ith factor  

Back</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/frequencieslist?rev=1323943719&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-15T11:08:39+02:00</dc:date>
        <title>frequencieslist</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/frequencieslist?rev=1323943719&amp;do=diff</link>
        <description>This argument is optional. It is a double array containing the list of frequencies selected for the computation. 

By default all the frequencies are included in the computation.

example: 


 mega_anova_with_sub (.........,'frequenciesList', [30, 32],.....)</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/frontal?rev=1292860668&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2010-12-20T16:57:48+02:00</dc:date>
        <title>frontal</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/frontal?rev=1292860668&amp;do=diff</link>
        <description>Le fontal est une machine linux visible de partout (même de l'extérieur). Voila son petit nom : megfront.meg.chups.jussieu.fr

Le frontal héberge les services suivants :

	*  Un serveur de sources:
	*  Un serveur SSH
	*  Un serveur FTP</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/guide_d_ondes?rev=1233933029&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2009-02-06T16:10:29+02:00</dc:date>
        <title>guide_d_ondes</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/guide_d_ondes?rev=1233933029&amp;do=diff</link>
        <description>Utilité

Principe


Un guide d'ondes se comporte comme un filtre passe-haut.

La fréquence de coupure ne dépend que du diamètre.

La formule est la suivante : Fc = (C . u) / (p . D)


	*  C : vitesse de la lumière (3.108 m/s)
	*  u = 1,841
	*  D : Diamètre (en m)
	*  Fc : Fréquence de coupure (en Hz)</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/how_to_install_it?rev=1323765692&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-13T09:41:32+02:00</dc:date>
        <title>how_to_install_it</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/how_to_install_it?rev=1323765692&amp;do=diff</link>
        <description>The package is located in:  /usr/global/matlab/mega_toolbox 


	*  Launch Matlab from your home directory (ex: /lena13/home_users/users/dupont) 

	*    Under the File menu, go to 'Set Path' 

	*    In the dialog window, click on 'Add with Subfolders'</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/how_to_use_it?rev=1323781999&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-13T14:13:19+02:00</dc:date>
        <title>how_to_use_it</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/how_to_use_it?rev=1323781999&amp;do=diff</link>
        <description>*  Before using anova you need to define what is your experimental design (within/between subject, how many factors, how many levels per factor..). 


In this tutorial, we consider a within-subject experiment. The steps to perform are as follows:


	*  Define your design structure
	*  Write a script in matlab to provide information about your data as well as your experimental design: Start by calling the main function:</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/informations_chercheurs?rev=1227289583&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2008-11-21T18:46:23+02:00</dc:date>
        <title>informations_chercheurs</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/informations_chercheurs?rev=1227289583&amp;do=diff</link>
        <description>Cette page a pour but de répondre le plus exhaustivement possible à une question aussi vaste qu'importante : &lt;&lt; Comment réaliser un protocole au CENIR ? &gt;&gt;

Se faire connaître du CENIR

Contacter l'équipe

Effectuer une présentation de projet


Les présentations de projets du CENIR ont généralement lieu les lundi après-midis de 16h30 à 17h30 au rez-de-chaussée du bâtiment Chaslin.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/informations_volontaires?rev=1227198226&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2008-11-20T17:23:46+02:00</dc:date>
        <title>informations_volontaires</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/informations_volontaires?rev=1227198226&amp;do=diff</link>
        <description>Cette page a pour vocation de donner un maximum d'explications précises aux volontaires en passe de (ou souhaitant) réaliser une étude cognitive au CENIR en tant que sujet.


IRM est l'acronyme d'Imagerie par Résonance Magnétique et IRMf d'Imagerie  par Résonance Magnétique fonctionnelle. Ce sont des techniques qui vont nous permettre de mettre en correspondance les structures du cerveau avec leur fonction en utilisant une machine IRM et ainsi d'analyser les informations obtenues. L'IRM et l'IRM…</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/informatique?rev=1292859813&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2010-12-20T16:43:33+02:00</dc:date>
        <title>informatique</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/informatique?rev=1292859813&amp;do=diff</link>
        <description>*  Le CENIR dispose de son réseau informatique propre qui est un sous réseau de l'Université Pierre et Marie Curie. Le plateau offre accès à une vingtaine de stations équipées des logiciels permettant l'analyse des signaux/images recueillis sur la plateforme.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/inscription_vrb?rev=1234274770&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2009-02-10T15:06:10+02:00</dc:date>
        <title>inscription_vrb</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/inscription_vrb?rev=1234274770&amp;do=diff</link>
        <description></description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/joystick_curdes?rev=1227097056&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2008-11-19T13:17:36+02:00</dc:date>
        <title>joystick_curdes</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/joystick_curdes?rev=1227097056&amp;do=diff</link>
        <description>Prise en main par le sujet


Le joystick peut être utilisé de deux manières différentes :

	*  Avec le manche, il se tient dans toute la paume de la main. Il est plus facile d'effectuer de grands déplacements dans une direction donnée.
	*  Sans le manche, il est utilisé à la manière d'un fingerstick, entre le pouce et l'index. Il est plus aisé de suivre des courbes avec précisions.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/la_meg_du_cenir?rev=1290000210&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2010-11-17T14:23:30+02:00</dc:date>
        <title>la_meg_du_cenir</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/la_meg_du_cenir?rev=1290000210&amp;do=diff</link>
        <description>Le centre renouvelle son magnétoencéphalographe:

En effet, après 12 années de bons et loyaux services notre CTF omega 151 cède sa place à l'Elekta Neuromag TRIUX.

Les enregistrements sur cette nouvelle machine débuteront à la mi-février 2011.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/lancer_des_calculs?rev=1254825347&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2009-10-06T12:35:47+02:00</dc:date>
        <title>lancer_des_calculs</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/lancer_des_calculs?rev=1254825347&amp;do=diff</link>
        <description>Travailler au cenir

Objectifs


Il s'agit de pouvoir lancer de long calculs sans bloquer un poste de travail, et donc sans risque d'arrêt brutal.

L'idée est simple : Au lieu d'utiliser une session sur un poste de travail on va utiliser une session virtuelle sur un serveur
(situé dans la salle serveur)</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/liens_cours_irm?rev=1248786688&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2009-07-28T15:11:28+02:00</dc:date>
        <title>liens_cours_irm</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/liens_cours_irm?rev=1248786688&amp;do=diff</link>
        <description>*   &lt;http://www.e-mri.org/fr/index.html&gt;


Ce site, entièrement traduit en français, propose un cours très complet à propos de points très théoriques sur la Résonance Magnétique Nucléaire jusqu'à des considérations plus pratiques sur les appareils IRM.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/locaux?rev=1255954813&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2009-10-19T14:20:13+02:00</dc:date>
        <title>locaux</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/locaux?rev=1255954813&amp;do=diff</link>
        <description>Le CENIR se trouve au sous-sol du bâtiment Paul Castaigne dans des locaux gracieusement prêtés par l'APHP. La plateforme dispose de 150 mètres carrés.

La salle de l'IRM


Entourée d'une cage de Faraday et d'une couche de blindage, cette salle contient l'appareil IRM de la plateforme.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/logiciels_de_stimulation?rev=1227289311&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2008-11-21T18:41:51+02:00</dc:date>
        <title>logiciels_de_stimulation</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/logiciels_de_stimulation?rev=1227289311&amp;do=diff</link>
        <description>Comparatif de différents logiciels disponibles sur le marché


La liste suivante est non exhaustive. Si vous y trouvez une erreur, merci de la signaler à eric.bertasi AT upmc.fr

Logiciel    Programmation    WYSIWYG    Animations
complexes    Design
complexe    Sons    Vidéos    Joystick
USB    Envoi signaux
(port série, parallèle, etc)    Prix  Cogent     x           x           x       x      x                                    x                   Gratuit  e-Prime        x            x       …</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/meg-eeg?rev=1332831837&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2012-03-27T09:03:57+02:00</dc:date>
        <title>meg-eeg</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/meg-eeg?rev=1332831837&amp;do=diff</link>
        <description>Nouvel utilisateur


Infos pratiques:

Une salle d'analyse est accessible au 1er étage de l'ICM en salle 1001.

Pour obtenir un badge d'accès, contacter joanna.harpon@upmc.fr en précisant vos coordonnées, le nom de votre manip, la durée souhaitée de validité du badge, ainsi qu'un de vos contacts au CENIR. En fin de manip, pensez à rendre votre badge.

Pour obtenir un compte sur un ordinateur, contacter denis.Schwartz@upmc.fr ou lydia.yahia-cherif@upmc.fr ou laurent.hugueville@upmc.fr</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/meg?rev=1286530369&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2010-10-08T11:32:49+02:00</dc:date>
        <title>meg</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/meg?rev=1286530369&amp;do=diff</link>
        <description>Généralités sur la MEG et l'EEG

	*  Historique
	*  Principe de fonctionnement d'un magnétoencéphalographe
	*  Cours d'électrophysiologie

Equipements de la plateforme

MEG

La machine MEG du CENIR

	*  Elekta Neuromag
 

Matériels périphériques

	*  Stimulation visuelle
	*  Stimulation auditive
	*  Stimulation somesthésique
	*  Eye-Tracker
	*  Systèmes de réponses</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/mega_read?rev=1334246361&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2012-04-12T17:59:21+02:00</dc:date>
        <title>mega_read</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/mega_read?rev=1334246361&amp;do=diff</link>
        <description>mega_read is a matlab function that reads MEG/EEG data from MEG-EEG files (.lena, .ds .fiff). It returns a header structure, and  binary data. 
 mega_read is compatible with matalab2011, not with matlab2007

Usage
  [ header, binary ] = mega_read(filename, varargin ) ==== Input ====     First argument
     - filename ( String ) : name of MEEG file, 
  
     Second argument
     - varargin  (list of string: is used if we don't need to read the whole data in the file. see below how it is used==== …</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/mega_toolbox?rev=1323940353&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-15T10:12:33+02:00</dc:date>
        <title>mega_toolbox</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/mega_toolbox?rev=1323940353&amp;do=diff</link>
        <description>T-test

Analysis of variance

	*  mega_anova


Back</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/menu1?rev=1288968384&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2010-11-05T15:46:24+02:00</dc:date>
        <title>menu1</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/menu1?rev=1288968384&amp;do=diff</link>
        <description>*  Accueil
	*  IRM
	*  MEG-EEG
	*  TMS
	*  Comportement
	*  Stimulation
	*  Informatique
	*  Données
	*  Recrutement de volontaires
	*  CPP</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/minuslogp?rev=1323943868&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-15T11:11:08+02:00</dc:date>
        <title>minuslogp</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/minuslogp?rev=1323943868&amp;do=diff</link>
        <description>Tis argument is optional. It is a boolean used only in case where -Log(p)is preferred to p value 

Note: This argument is a boolean and is single (is not a named argument with a name and a value)


Back</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/muse?rev=1278323838&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2010-07-05T11:57:18+02:00</dc:date>
        <title>muse</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/muse?rev=1278323838&amp;do=diff</link>
        <description>Logiciel développé par Jean-Didier LEMARECHAL

muse est un outil de visualisation de données, développé à partir des spécifications du format LENA.
Il offre la possibilité de visualiser ses données sous différentes formes ( courbe, nappe, cartographie ) et d'organiser ces objets dans des pages ( hiérarchie de dimensions, synchronisations temporelle, spatiale, ... ).</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/nature_des_signaux_et_des_capteurs?rev=1288701219&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2010-11-02T13:33:39+02:00</dc:date>
        <title>nature_des_signaux_et_des_capteurs</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/nature_des_signaux_et_des_capteurs?rev=1288701219&amp;do=diff</link>
        <description>Les signaux

	*  notions d'électrophysiologie

	*  signaux MEG

	*  signaux EEG

Les capteurs

	*  capteurs MEG

	*  capteurs EEG</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/notions_d_electrophysiologie?rev=1332832461&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2012-03-27T09:14:21+02:00</dc:date>
        <title>notions_d_electrophysiologie</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/notions_d_electrophysiologie?rev=1332832461&amp;do=diff</link>
        <description>!!page en construction!!

Bases de Neurophysiologie


	*  Le cerveau à tous les niveaux : &lt;http://www.thebrain.mcgill.ca/flash/a/a_01/a_01_cl/a_01_cl_fon/a_01_cl_fon.html&gt;
		*  Wikipedia : &lt;http://en.wikipedia.org/wiki/Action_potential&gt;


Neuroanatomie</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/outils_centre_meg-eeg?rev=1323939653&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-15T10:00:53+02:00</dc:date>
        <title>outils_centre_meg-eeg</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/outils_centre_meg-eeg?rev=1323939653&amp;do=diff</link>
        <description>I/O

	*  mega_read
	*  mega_write
	*  mega_conv
	*  mega_handler

Pre-processing

	*  mega_handler
	*  mega_muse

Analysis

	*  Statistical tests
	*  Clustering
	*  Time/Frequency
	*  Synchrony computation
	*  Connectivity

Visualisation

	*  mega_muse
	*  mega_draw</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/pathin?rev=1323946832&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-15T12:00:32+02:00</dc:date>
        <title>pathin</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/pathin?rev=1323946832&amp;do=diff</link>
        <description>This argument is optional. It is a string that specifies the Path to the folder where the input files (as defined in your FileStruct ) are located.

If not specified, the files are searched in the current folder (displayed in Matlab)


Example:

 ('PathIn', '/lena13/home_users/users/datalinks/MYMANIP') 

or 

('PathIn','/lena13/home_users/users/datalinks/MYMANIP/')</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/pathout?rev=1323943604&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-15T11:06:44+02:00</dc:date>
        <title>pathout</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/pathout?rev=1323943604&amp;do=diff</link>
        <description>This argument is optional. It is a string that specifies the path to the folder where to write the output .lena files of the analysis. 

If not specified, the files are written in the current folder.


Example: ('PathOut','/pclxserver/data/users/datalinks/MYMANIP/MyAnovaResult')</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/philosophie_generale?rev=1291903392&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2010-12-09T15:03:12+02:00</dc:date>
        <title>philosophie_generale</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/philosophie_generale?rev=1291903392&amp;do=diff</link>
        <description>1. Artefact detection and/or correction

Blinks, saccades, ECG, muscle , alpha

2. Managing Markers

Decoding the subject's responses

Combining markers

Analyzing behavior

Analyzing data at the sensor level
 Computing ERFs
 Computing Time-frequency plots
 Visualizing data
 Statistical analysis
    Defining spatial regions and temporal windows of interest
    Cluster-based approach
    
Source localization</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/script?rev=1323943412&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-15T11:03:32+02:00</dc:date>
        <title>script</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/script?rev=1323943412&amp;do=diff</link>
        <description>*  open a New File in Matlab Menu (File/New/M-File): This will open a new editor window
	*  Write down your LenaFiles variable as below: (Suppose you have only .lena files)


     lenaFiles{1,1,1}= {'file1111.lena', 'file1112.lena', .... 'file111n.lena'}; 
     lenaFiles{1,1,2}= {'file1121.lena', 'file1122.lena', .... 'file112n.lena'}; 
     lenaFiles{1,2,1}= {'file1211.lena', 'file1212.lena', .... 'file121n.lena'};
     .
     .
     .
     lenaFiles{2,3,2}= {'file2321.lena', 'file2322.lena', .…</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/sensorlist?rev=1323943695&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-15T11:08:15+02:00</dc:date>
        <title>sensorlist</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/sensorlist?rev=1323943695&amp;do=diff</link>
        <description>This argument is optional. It is an array of strings containing the list of sensors selected for the computation.

By default all the sensors are included in the computation.


example: 

 mega_anova_with_sub(........,'sensorList', {'MLT15', 'MLT16'},.....)</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/serveurs_calculs?rev=1292860950&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2010-12-20T17:02:30+02:00</dc:date>
        <title>serveurs_calculs</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/serveurs_calculs?rev=1292860950&amp;do=diff</link>
        <description>Le serveur de calcul est une grosse boite contenant une centaine de stations de travail très puissantes dédiées aux calculs lourds sous linux (temps fréquence / localisation / analyse IRM(f)) et à matlab. Vous pouvez visualiser la charge des lames de calcul en temps réel ici</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/signedf?rev=1323943765&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-15T11:09:25+02:00</dc:date>
        <title>signedf</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/signedf?rev=1323943765&amp;do=diff</link>
        <description>This argument is optional. It is a small trick for advanced users.

it is a Boolean used only in the case where each factor Ai  has exactly two levels, with means mi1 and mi2 for the levels 1 and 2 of the ith factor. 

If mi1&lt;mi2, the F value for the effect of Ai will be multiplied by -1.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/statistical_tests?rev=1323783961&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-13T14:46:01+02:00</dc:date>
        <title>statistical_tests</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/statistical_tests?rev=1323783961&amp;do=diff</link>
        <description></description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/stimulation?rev=1233931524&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2009-02-06T15:45:24+02:00</dc:date>
        <title>stimulation</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/stimulation?rev=1233931524&amp;do=diff</link>
        <description>Le CENIR dispose de divers systèmes d'envoi de stimuli et d'enregistrement de données péri-IRM.
Voici un schéma du matériel de stimulation de base, utilisé dans quasiment tous les protocoles cognitifs :



Cliquez pour agrandir.

Pour tout renseignement complémentaire, question ou rectification, veuillez contacter les responsables stimulation du CENIR :

eric.bertasi at upmc.fr

fouzi.hida at upmc.fr</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/stimulation_audio?rev=1228418710&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2008-12-04T20:25:10+02:00</dc:date>
        <title>stimulation_audio</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/stimulation_audio?rev=1228418710&amp;do=diff</link>
        <description>Nous avons retenu la société MR Confon pour la fiabilité et la facilité d'utilisation de son matériel.



Domaine d'application

Usage courant


Le matériel audio MR Confon permet de :


	*  communiquer avec le sujet
	*  le stimuler auditivement
	*  lui passer de la musique ou la piste son d'une vidéo (pendant des séquences sans tâche à accomplir)
	*  enregistrer le sujet entre deux séquences IRM et pendant une séquence fonctionnelle EPI (avec un système de suppression du bruit).</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/stimulation_et_materiels_peripheriques?rev=1290002830&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2010-11-17T15:07:10+02:00</dc:date>
        <title>stimulation_et_materiels_peripheriques</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/stimulation_et_materiels_peripheriques?rev=1290002830&amp;do=diff</link>
        <description>Logiciels de stimulation


- Omnistim

- Eprime

- Psychtoolbox (matlab)

- Cogent

Matériels de stimulation


Le centre MEG permet des stimulations visuelles, auditives, et somesthésiques:

- Vidéoprojecteur

- Système audio

- Générateur d'impulsions électriques</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/stimulation_video?rev=1254740133&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2009-10-05T12:55:33+02:00</dc:date>
        <title>stimulation_video</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/stimulation_video?rev=1254740133&amp;do=diff</link>
        <description>Matériel


Le CENIR dispose d'un projecteur EPSON, l'EMP-8300, surmonté d'une lentille NAVITAR, la 880MCZ123, en ce qui concerne la projection de stimuli vidéo.



L'utilisation normale de ce matériel est la projection vidéo en fond de salle (une image de plusieurs mètres de côté à une dizaine de mètres de distance) et nous allons l'utiliser pour projeter une image de quelques décimètres de côté à environ quatre mètres. Nous avons choisi cet EPSON parce qu'il présentait une grande versatilité, a…</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/synchronisation?rev=1259848519&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2009-12-03T14:55:19+02:00</dc:date>
        <title>synchronisation</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/synchronisation?rev=1259848519&amp;do=diff</link>
        <description>Synchronisation avec le PC de stimulation


Les signaux envoyés par l'IRM sont récupérés par le boîtier fORP et envoyé au PC de stimulation via la connectique choisie.

Fiabilité du système


Lors du test du banc de stimulation du 3 décembre 2009, aucun trigger n'a été perdu sur un total de 40000.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/t-test?rev=1323682697&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-12T10:38:17+02:00</dc:date>
        <title>t-test</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/t-test?rev=1323682697&amp;do=diff</link>
        <description></description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/tarifs?rev=1229002025&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2008-12-11T14:27:05+02:00</dc:date>
        <title>tarifs</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/tarifs?rev=1229002025&amp;do=diff</link>
        <description>Grille tarifaire par défaut
  Vous appartenez à    Tarif horaire (en €)    Tarif horaire le week-end (en €)    un laboratoire issu d'un institut partenaire du CENIR    150    180    un autre institut public    300    330    un projet européen, une fondation    450    480    une industrie pharmaceutique    600    630  

Les montants indiqués sont hors taxe.</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/timerange?rev=1323943741&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2011-12-15T11:09:01+02:00</dc:date>
        <title>timerange</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/timerange?rev=1323943741&amp;do=diff</link>
        <description>This argument is optional. It is a double array of the time interval in seconds to be considered for the computation. 

By default, the computation is performed on the whole time range.

example:


 mega_anova_with_sub (.........,'timeRange', [0, 0.1],.....)</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/tms?rev=1228997483&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2008-12-11T13:11:23+02:00</dc:date>
        <title>tms</title>
        <link>http://wiki.cenir.org/doku.php/tms?rev=1228997483&amp;do=diff</link>
        <description>La stimulation magnétique transcranienne (ou TMS, abréviation de l'anglais Transcranial Magnetic Stimulation) est une technique médicale utilisée dans le diagnostic des maladies neurologiques, comme outil d'investigation scientifique en neurosciences et comme traitement clinique dans certaines affections psychiatriques. Elle consiste en l'application d'une impulsion magnétique sur le cerveau à travers le crâne de façon indolore en plaçant une bobine à la surface de la tête. Ces champs magnétique…</description>
    </item>
    <item rdf:about="http://wiki.cenir.org/doku.php/toolboxes_installees?rev=1327592237&amp;do=diff">
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        <title>toolboxes_installees</title>
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        <description>*   Brainstorm 

	*  Fieldtrip

	*   SPM</description>
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        <title>trio_tim_3t</title>
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        <description>Description

Description technique


C'est une machine SIEMENS TRIO TIM 102×32.

Le champ magnétique de la machine est de 3 Teslas.

La version du logiciel de la machine est la VB15.

Informations pratiques

	*  Le tunnel de l'IRM fait 60 cm de diamètre</description>
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